summary refs log tree commit diff
path: root/pkgs/applications/science/biology
Commit message (Expand)AuthorAge
* mosdeph: fix compilation with nim 0.19royneary2018-10-31
* star: 2.6.1a -> 2.6.1cR. RyanTM2018-10-24
* bowtie2: 2.3.4.2 -> 2.3.4.3R. RyanTM2018-10-03
* picard-tools: 2.18.12 -> 2.18.14 (#46978)R. RyanTM2018-09-29
* platypus: 2017-03-07 -> 2018-07-22Orivej Desh2018-09-21
* samtools: 1.8 -> 1.9Orivej Desh2018-09-21
* seaview: init at 4.7 (#46595)Markus J. Ankenbrand2018-09-13
* star: 2.6.0c -> 2.6.1a (#46176)R. RyanTM2018-09-12
* Merge pull request #45102 from jbedo/hisat2Matthew Bauer2018-09-10
|\
| * hisat2: init 2.1.0Justin Bedo2018-08-17
* | picard-tools: 2.18.11 -> 2.18.12R. RyanTM2018-09-06
* | Merge pull request #45263 from r-ryantm/auto-update/bowtie2xeji2018-08-21
|\ \
| * | bowtie2: broken on aarch64Uli Baum2018-08-21
| * | bowtie2: 2.3.4.1 -> 2.3.4.2R. RyanTM2018-08-17
| |/
* | Merge pull request #44250 from jbedo/strelkaJoachim F2018-08-20
|\ \
| * | strelka: init 2.9.5Justin Bedo2018-08-20
* | | Merge branch 'staging-next'Vladimír Čunát2018-08-17
|\ \ \
| * \ \ Merge branch 'master' into staging-nextVladimír Čunát2018-08-17
| |\ \ \
| * \ \ \ Merge branch 'master' into staging-nextVladimír Čunát2018-08-13
| |\ \ \ \ | | | |_|/ | | |/| |
| * | | | Merge remote-tracking branch 'upstream/master' into stagingTuomas Tynkkynen2018-08-04
| |\ \ \ \
| * | | | | treewide: Make configureFlags listsJohn Ericson2018-08-03
* | | | | | Merge pull request #45217 from r-ryantm/auto-update/igvJörg Thalheim2018-08-17
|\ \ \ \ \ \ | |_|_|_|/ / |/| | | | |
| * | | | | igv: 2.4.13 -> 2.4.14R. RyanTM2018-08-17
| | |_|/ / | |/| | |
* / | | | picard-tools: 2.18.10 -> 2.18.11R. RyanTM2018-08-16
|/ / / /
* | / / vcftools: 0.1.15 -> 0.1.16R. RyanTM2018-08-08
| |/ / |/| |
* | | somatic-sniper: disable parallel buildingUli Baum2018-08-03
|/ /
* / somatic-sniper: init 1.0.5.0 (#43403)Justin Bedő2018-08-01
|/
* bcftools: 1.8 -> 1.9 (#43950)R. RyanTM2018-07-30
* Merge pull request #43913 from r-ryantm/auto-update/picard-toolsFrederik Rietdijk2018-07-22
|\
| * picard-tools: 2.18.9 -> 2.18.10R. RyanTM2018-07-21
* | pkgs/*: remove unreferenced function argumentsvolth2018-07-21
|/
* igv: 2.4.11 -> 2.4.13R. RyanTM2018-07-13
* igv: 2.4.10 -> 2.4.11 (#43003)R. RyanTM2018-07-09
* Merge pull request #43096 from jbedo/mosdepthSilvan Mosberger2018-07-09
|\
| * mosdepth: init 0.2.3Justin Bedo2018-07-09
* | picard-tools: 2.18.7 -> 2.18.9 (#42967)R. RyanTM2018-07-06
|/
* Merge pull request #42571 from iimog/hmmerMatthew Bauer2018-06-28
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| * hmmer: init at 3.1b2Markus Ankenbrand2018-06-25
* | treewide: http -> https sources (#42676)Silvan Mosberger2018-06-28
|/
* picard-tools: 2.18.5 -> 2.18.7 (#41975)R. RyanTM2018-06-18
* raxml: 8.2.11 -> 8.2.12 (#41964)R. RyanTM2018-06-18
* picard-tools: 2.18.4 -> 2.18.5R. RyanTM2018-05-26
* star: 2.5.3a -> 2.6.0c (#40518)Arcadio Rubio García2018-05-15
* minimap2: init at 2.10Arcadio Rubio García2018-05-14
* picard-tools: 2.18.3 -> 2.18.4R. RyanTM2018-05-12
* Merge pull request #39740 from r-ryantm/auto-update/picard-toolsMatthew Justin Bauer2018-05-04
|\
| * picard-tools: 2.18.2 -> 2.18.3R. RyanTM2018-04-30
* | paml: 4.9g -> 4.9hR. RyanTM2018-05-03
* | conglomerate: init at 2017-09-10Ben Darwin2018-04-27
|/
* Merge branch 'master' into minc_ecosystemJörg Thalheim2018-04-21
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